Regierungen, Wissenschaftler und Forschungseinrichtungen nutzen Technologie und Innovation, um COVID-19 zu bekämpfen.
Es wurden Open-Source-Tools entwickelt, und einige werden weiterhin getestet, um die Bemühungen zu unterstützen, die unternommen wurden, um die Folgen dieses tödlichen Virus zu minimieren.
Es gibt bereits eine Reihe von Open-Source-Tools, die Forschern helfen, mehr über die Krankheit zu erfahren, die Ausbreitung zu identifizieren, die Ausbreitung zu verhindern und die weitere Ausbreitung und Todesfälle zu minimieren. Eine Reihe von Projekten ist auf der verfügbar Bildungs-Ökosystem die umreißt, wie man verschiedene Werkzeuge verwendet.
Dieser Artikel befasst sich mit einigen der Open-Source-Tools und -Bibliotheken, die zur Überwachung, Prävention und Eindämmung, Diagnose und Behandlung von COVID-19 verwendet werden.
Inhaltsverzeichnis
COVID-19-Tracking-Karte
Im Januar startete das Center for Systems Science and Engineering der JHU a COVID-19 Globale Tracking-Karte das schnell zu einer international vertrauenswürdigen Quelle für die Daten der sich entwickelnden Pandemie in Echtzeit wurde.
Die Karte ist Open Source und wurde verwendet, um Forschungs- und Visualisierungsbemühungen von führenden Medienorganisationen, kleinen Organisationen und lokalen Regierungen voranzutreiben.
DXY-COVID-19-Crawler
DXY-COVID-19-Crawler ist eines der frühesten Open-Source-Projekte, das entwickelt wurde, um auf COVID-19 im Januar zu reagieren.
Die Entwickler nutzten Daten von DXY.cn, einer Website, die von chinesischen Ärzten verwendet wurde, um Fälle zu melden und zu verfolgen. Sie entwickelten einen Webcrawler, der Daten von der Website sammelte und sie über eine API und ein Data Warehouse verfügbar machte. Der Code ist verfügbar unter GitHub.
Datenkit öffnen
Open-Data-Kit (ODK) ist kein neues Werkzeug. Es wurde bereits während der Ebola-Ausbrüche in Westafrika im Jahr 2004 und des neueren Ausbruchs in der Demokratischen Republik Kongo im Jahr 2019 eingesetzt.
Es hilft Benutzern hauptsächlich dabei, Daten bei der Kontaktverfolgung, der strategischen Kartierung, der Entscheidungsunterstützung, der Sensibilisierung der Gemeinschaft und dem Fallmanagement zu sammeln, zu verwalten und zu verwenden.
Die ODK-Community hat ihre Verwendung als Reaktion auf COVID-19 weiter vorangetrieben, indem sie in ihren Bereitstellungen ein Meldeformular zur Verfügung gestellt hat. Das Formular ist gemäß dem Protokoll der Weltgesundheitsorganisation für die Untersuchung von Fällen und die Ermittlung und Ermittlung von Kontaktpersonen konzipiert.
Die leitenden Entwickler bieten außerdem kostenlosen Support für alle Organisationen an, die das ODK als Reaktion auf COVID-19 eingesetzt haben.
Nextstrain
Nextstrain verfolgt die Entwicklung von Krankheitserregern. Es wurde bisher verwendet, um die Familiengeschichte einer Krankheit zu ermitteln und so den Krankheitsverlauf vorhersagen zu können.
Es wurde erfolgreich bei früheren Epidemien wie Ebola eingesetzt. Durch genetische Daten der Global Initiative on Sharing All Influenza Data (Gisaid) wird Nextxtrain zur Bekämpfung von COVID-19 eingesetzt.
DHIS2
Du weißt es wahrscheinlich schon DHIS2. Es ist das weltweit größte Health Information Management System. Es wird in mehr als 70 Ländern verwendet. Als Teil der Reaktion auf COVID-19 hat DHIS2 ein digitales Datenpaket veröffentlicht, das die Erkennung, Meldung, Überwachung und Behandlung von Infektionen beschleunigt.
Das digitale Datenpaket DHIS2 nutzt Standardmetadaten, die mit dem WHO-Protokoll zur COVID-19-Falldefinition und -Überwachung abgestimmt sind, um eine schnelle Bereitstellung und Reaktion zu ermöglichen.
Pikobar West-Java
Das indonesische Informations- und Koordinierungszentrum für Krankheiten und Katastrophen ist ein Krisenreaktionszentrum, das gegründet wurde, um COVID-19 in der indonesischen Provinz West-Java abzuschwächen und darauf zu reagieren.
Der Jabar Digital Service hat als Teil der Reaktion eine entwickelt Open-Source-Webtool und -App die Benutzern den Zugriff auf die neuesten COVID-19-Daten ermöglicht.
OpenMRS
OpenMRS ist ein Patientenversorgungssystem, das in vielen Entwicklungsländern auf der ganzen Welt eingesetzt wird. Aufgrund der Flexibilität des OpenMRS-Systemkönnen Länder, deren Gesundheitsressourcen überlastet waren, es für die Überwachung, das Screening und die Behandlung von COVID-19 nutzen.
Das System kann ihnen helfen, ihre Kapazitäten zu erweitern, indem es ihnen Zugang zu wissenschaftlich fundierten Informationen zur Bewältigung der Krise verschafft.
OpenLMIS
Das OpenLMIS-Projekt nutzt eine Community-fokussierte Taktik, um ein Open-Source- und ein anpassbares Logistikmanagement-Informationssystem zu entwickeln. Das OpenLMIS-System versucht, die Datengenauigkeit zu verbessern, die Rechenschaftspflicht zu erhöhen, die Aktualität der Daten und die Sichtbarkeit zu verbessern.
Das OpenLMIS-System zielt darauf ab, die Versorgungsketten im Gesundheitswesen und die Bestandsaufnahme medizinischer Ressourcen zu verbessern, um ein klares Bild der verfügbaren medizinischen Versorgung, einschließlich Testkits, und PSA (persönliche Schutzausrüstung) zu liefern. Dieses Tool kann effektiv eingesetzt werden, um Entscheidungsträger bei der Zuweisung von Ressourcen als Reaktion auf COVID-19 zu unterstützen.
Gesundheitsseiten
Das Global Healthsites Mapping Project ist ein Projekt, das darauf abzielt, jede Gesundheitseinrichtung der Welt zu kartieren und die Details jedes Krankenhauses leicht zugänglich zu machen. Die Daten zu Gesundheitseinrichtungen wurden über eine API zugänglich gemacht.
Durch die Zusammenarbeit mit Benutzern erfasst und validiert das Team von healthsites.io den Standort und die Kontaktdaten jeder Gesundheitseinrichtung und macht die Daten frei verfügbar und über eine Open-Data-Lizenz zugänglich.
Sormas
SORMAS (Surveillance Outbreak Response Management and Analysis System) ist ein mobiles Open-Source-E-Gesundheitssystem. Es wurde eingesetzt, um Seuchenbekämpfungs- und Ausbruchsmanagementverfahren umzusetzen.
Es wurde in mehreren Ländern, darunter Ghana, Nigeria, Nepal und Fidschi, zur Überwachung und Früherkennung von COVID-19 effektiv eingesetzt.
SORMAS ist ein kostenloses Open-Source-System, das Datenschutzstandards einhält.
Tokio COVID-19
Im Gegensatz zu vielen anderen Städten und Regierungen ist die Stadtregierung von Tokio hat eine Open-Source-Website entwickelt, die ihre Bewohner über COVID-19 informiert. Durch die Open-Source-Version hat die Website Beiträge von über 200 Benutzern gesehen. Drei weitere Städte, Chiba, Nagano und Fukuoka, haben die Website neu erstellt.
OpenELIS
Der Zweck der OpenELIS-Gesundheitssystem ist die Verbesserung der Gesundheitsversorgung durch die Bereitstellung eines fortschrittlichen, auf Standards basierenden Laborinformationsmanagementsystems, das von verschiedenen Gesundheitsinitiativen zur Verbesserung der Behandlungsoptionen verwendet werden kann.
Der COVID-19-Ausbruch hat die Kontaktnachverfolgung und Massentests von Verdachtsfällen zu einer globalen Herausforderung gemacht. Das OpenELIS-System kann effektiv zur Bekämpfung von COVID-19 eingesetzt werden, um die Nachverfolgung von Labortests und -ergebnissen zu erleichtern.
Das Community-Gesundheits-Toolkit ist eine Sammlung von Open-Source-Tools sowie Open-Access-Ressourcen, die darauf abzielt, digitale Tools für den Einsatz in kommunalen Gesundheitsinitiativen in schwer zugänglichen Bereichen zu erstellen und einzusetzen.
Die Community Health Toolkit-Entwicklergemeinschaft hat sich mobilisiert, um Tools und Ressourcen zu entwickeln, die darauf abzielen, kommunale Gesundheitsarbeiter bei der Bekämpfung von COVID-19 zu unterstützen.
GLOCKEN
Das COVID-19 Hospital Impact Model for Epidemics (CHIME) ist eine Open-Source-Anwendung, die von Datenwissenschaftlern der Penn Medicine – University of Pennsylvania entwickelt wurde. Es ist ein Online-Tool, mit dem Krankenhäuser die Auswirkungen des Virus auf die Ressourcen des Gesundheitswesens vorhersagen können.
Es wird mit Python und der Pandas-Open-Source-Abhängigkeit entwickelt.
COVID-Pflegekarte
Das COVID-Pflegekarte hilft bei der Kartierung der bereits vorhandenen Gesundheitsressourcen und bei der Prognose von Lücken bei Krankenhausbetten, Beatmungsgeräten, medizinischer Versorgung und Personalausstattung. Alle Methoden, Datenverarbeitungswerkzeuge, Visualisierungen und Quellcodes sind kostenlos und Open Source.
Das COVID-Care-Map-Projekt soll antizipieren und handeln, um Unterstützung für eine wirksame Versorgung der schnell wachsenden Zahl von COVID-19-Infektionen und Intensivpflegebedürftigen zu erhalten.
Gebietsschema.ai
Locale.ai hat eine interaktive Open-Source-Visualisierung aller bestätigten Fälle von COVID-19 auf der ganzen Welt entwickelt. Es fragt den Open-Source-Datensatz der John Hopkins University ab.
Locale.ai hat die entwickelt COVID-19-Visualisierungswebsite durch die Verwendung von Vue.js, einem beliebten Framework, mit dem Entwickler moderne Web-Apps erstellen können.
COVID-19 auf der ganzen Welt
Diese App verwendet eine Kartenvisualisierung, um die Ausbreitung von COVID-19, die bestätigten Fälle und die Entwicklung der Krankheit auf der ganzen Welt zu überwachen. Es nutzt Daten von John Hopkins CSSE.
Coronavirus-Tracker
Dies ist eine Shiny-App, die von John Coene entwickelt wurde. Es verfolgt die Verbreitung von COVID-19 anhand von Daten von John Hopkins, DXY-Daten und Weixin. Die App zeigt die Anzahl der Verdachtsfälle, bestätigten und wiederhergestellten Fälle nach Zeit und Region. Der Code ist verfügbar unter GitHub.
COVID-19 Globale Fälle
COVID-19 Globale Fälle ist eine von Christoph Schoenenberger entwickelte Shiny-App, die die Entwicklungen von COVID-19 auf einer Karte, Diagrammen, Übersichtstabellen und Zahlen darstellt. Sein Code ist auf Github verfügbar.
Regierungen und COVID-19
Dies ist eine Shiny-App, die von entwickelt wurde Sebastian Engel-Wolf. Es bildet das exponentielle Wachstum von COVID-19, die Tage bis zur Doppelinfektion, die bestätigten Fälle, die Sterblichkeitsrate und die Anzahl der bestätigten Fälle pro 100.000 Menschen in verschiedenen Regionen ab. Der Code ist auf Github verfügbar.
Einpacken
Die Open-Source-Community hat schnell und effektiv auf die COVID-19-Pandemie reagiert. Viele Projekte wurden gebaut und werden weiterhin gebaut, um die Ausbreitung der Krankheit zu bekämpfen. Dieser Artikel beschreibt einige der Projekte. Wie sich die Krankheit in den nächsten Wochen entwickeln wird, ist noch ungewiss. Weitere Projekte, die die bestehenden Open-Source-Technologien nutzen können, werden einen Platz im Kampf gegen diese tödliche Krankheit finden.
Pass auf dich auf!
Artikel von Dr. Michael J. Garbade, CEO, Education Ecosystem